W porcie gdyńskim rozpoczął pracę Graniczny Punkt Kontroli Weterynaryjnej (GPKW), spełniający wymogi Unii Europejskiej. Jest to kolejny, trzeci, punkt tego typu na polskiej granicy morskiej, która od 1 maja 2004 roku będzie zewnętrzną granicą Unii. 11 pozostałych obiektów znajdzie się na polskiej granicy wschodniej. Ich zadaniem jest zbadanie towarów pochodzenia zwierzęcego przed wjazdem na teren unijny. Inwestycja gdyńska, o wartości około 8 mln zł, sfinansowana została ze środków rządowych, a wykonana w ciągu 6 miesięcy przez Korporację Budowlaną "Doraco" Sp. z o.o. w Gdańsku. Mieści się w strefie celnej Bałtyckiego Terminalu Kontenerowego, gdyż większość produktów zwierzęcych dostarczana jest w kontenerach. Umożliwia dokonanie 6000 odpraw weterynaryjnych rocznie. GPKW zajmuje powierzchnię 2300 m2, połowę dawnego magazynu owoców cytrusowych, który został przebudowany stosownie do nowych potrzeb. Dysponuje trzema stanowiskami rozładowczymi, chłodzonymi magazynami, laboratoriami, miejscami przetrzymywania zwierząt żywych (w tym dla potrzeb kwarantanny) oraz biurami i pomieszczeniami technicznymi. Produkty pochodzenia zwierzęcego - podzielone na jadalne i niejadalne - są sprawdzane w wydzielonych, odrębnych strefach kontroli. Przy budowie gdyńskiego GPKW zastosowano najnowocześniejsze rozwiązania architektoniczne, technologiczne i materiałowe. Stanowiska przetrzymywania zwierząt umożliwiają w pełni ich humanitarne trakowanie. Obiekt dysponuje systemami wentylacji i klimatyzacji, komputerowego monitorowania i sterowania chłodniami, kanalizacją, kierującą ścieki do zbiornika, chroniącego środowisko przed skażeniami oraz pomieszczeniami dostosowanymi do potrzeb klimatycznych zwierząt egzotycznych. System informatyczny GPKW połączony jest z unijną instytucją centralną w Dublinie.