Promy Unity Line cechuje wysoki poziom bezpieczeństwa i nowoczesność zastosowanych rozwiązań. Niezawodność systemów potwierdzają liczne certyfikaty, a przyjęte standardy działania i nadzoru cenione są na całym świecie. Gwarantuje to pełne bezpieczeństwo pasażerów i przewożonych ładunków.
Od samego początku celem strategicznym Unity Line jest świadczenie najwyższej jakości usług w zakresie przewozów pasażerskich i towarowych. Jednym z najważniejszych elementów zarządzania jest zapewnienie bezpieczeństwa na promach. Bezpieczeństwo to, rozumiane jest wielowymiarowo i składa się na nie wiele obszarów "szczególnej troski". Są to m.in.: bezpieczeństwo pasażerów podczas podróży, ochrona zdrowia i bezpieczeństwo pracy oraz ochrona środowiska naturalnego.
Spółka posiada certyfikowany przez Lloyd Register oraz Polski Rejestr Statków system zgodny z wymaganiami kodeksu isM (Międzynarodowego Kodeksu Zarządzania Bezpieczną Eksploatacją Statków i Zapobieganiem Zanieczyszczeniu). System ten funkcjonuje na wszystkich promach Unity Line i zapewnia realizację polityki bezpieczeństwa i ochrony środowiska według najwyższych światowych standardów.
Unity Line posiada też certyfikowany przez Polski Rejestr Statków S.A. System Zarządzania Jakością zgodny z wymaganiami normy iso 9001:2000. System gwarantuje realizowanie usług żeglugowych na stałym, oczekiwanym przez klienta poziomie jakościowym i umożliwia utrzymanie wysokiej sprawności ekonomicznej firmy przy zachowaniu opinii niezawodnego przewoźnika.
Spośród wielu certyfikatów posiadanych przez Unity Line należy jeszcze wymienić certyfikat Det norske Veritas, uznający najwyższą jakość skomputeryzowanego systemu zarządzania obsługą techniczną promów oraz tytuł "solidny Partner". Warto też odnotować funkcjonowanie na promach Skania i Polonia systemu bezpieczeństwa zdrowotnego żywności, potwierdzonego certyfikatami HACCP. Planowane w najbliższym czasie pełne wdrożenie systemu zarządzania środowiskowego zgodnego z normą iso 14001:2004 zminimalizuje negatywne oddziaływanie na środowisko.